Dinamakan Gua Lowo karena ditempat ini banyak kekelawar (Lowo) yang tinggal di dalam gua ini dan berjumlah ratusan. Banyaknya kelelawar mulai dari yang besar sampai yang kecil, merupakan keunikan dari gua ini. Saat memasuki gua, Anda dapat menyaksikan kelelawar yang bergelantungan pada atap, dinding, dan sudut gua.

Selain adanya kelelawar,  jalan yang sempit serta tebing yang terjal membuat gua ini memilki nuansa mistik sehingga dari dulu hingga sekarang banyak orang yang melakukan ritual bertapa ditempat ini.